Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GIPC1O14908 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC1O14908 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms