Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F3O00716 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F3O00716 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F3O00716 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F3O00716 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F3O00716 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F3O00716 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F3O00716 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms