Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAP23O00161 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms