Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCER2I3L3R5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCER2I3L3R5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms