Protein–RNA interactions for Protein: B1AJZ1

C1orf196, Putative uncharacterized protein C1orf196, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf196B1AJZ1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1orf196B1AJZ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms