Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDR42E2A6NKP2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDR42E2A6NKP2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms