Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C5orf60A6NFR6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf60A6NFR6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms