Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms