Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00862A6NCI5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms