Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VWA3AA6NCI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms