Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U3KQK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U3KQK5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
U3KQK5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
U3KQK5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
U3KQK5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms