Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX9Q9Y5X1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms