Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SUPT16HQ9Y5B9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SUPT16HQ9Y5B9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms