Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP12Q9Y561 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms