Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms