Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1Q9Y3L3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms