Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP11BQ9Y2G3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP11BQ9Y2G3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms