Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUDCQ9Y266 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NUDCQ9Y266 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUDCQ9Y266 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms