Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS2Q9Y248 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINS2Q9Y248 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms