Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF9BQ9UPX0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms