Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PHF8Q9UPP1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHF8Q9UPP1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms