Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHTF1Q9UMS5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms