Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAL4Q9UM19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms