Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FZD4Q9ULV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FZD4Q9ULV1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms