Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB23Q9ULC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms