Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXO4Q9UKT5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO4Q9UKT5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms