Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN16Q9UKR8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN16Q9UKR8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms