Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJD2Q9UKL4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJD2Q9UKL4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms