Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH22Q9UJ99 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms