Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAI1Q9UI46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAI1Q9UI46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms