Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A2Q9UI40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms