Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAE1Q9UBE0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAE1Q9UBE0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms