Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CC2D2AQ9P2K1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CC2D2AQ9P2K1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CC2D2AQ9P2K1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms