Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HCN3Q9P1Z3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HCN3Q9P1Z3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms