Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms