Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMOD3Q9NYL9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms