Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL11Q9NVR0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms