Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
INTS9Q9NV88 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
INTS9Q9NV88 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms