Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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