Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATG3Q9NT62 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG3Q9NT62 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms