Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CENPMQ9NSP4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms