Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms