Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GDF3Q9NR23 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms