Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C8orf4Q9NR00 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C8orf4Q9NR00 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms