Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HPS4Q9NQG7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPS4Q9NQG7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms