Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRC4Q9NPP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms