Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PCDH12Q9NPG4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDH12Q9NPG4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms