Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB18Q9NP72 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms