Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms