Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
COG4Q9H9E3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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